Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hipk3Q9ERH7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms