Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER80

Rtp4, Receptor-transporting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp4Q9ER80 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms