Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms