Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn12Q9ER56 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms