Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sil1Q9EPK6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sil1Q9EPK6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms