Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP79

Vmn1r52, Vomeronasal type-1 receptor 52, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r52Q9EP79 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r52Q9EP79 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms