Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Hmg20aQ9DC33 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Hmg20aQ9DC33 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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