Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a3Q9DC26 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms