Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms