Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cbx6Q9DBY5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms