Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms