Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SrpraQ9DBG7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms