Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph3bQ9DA80 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rsph3bQ9DA80 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph3bQ9DA80 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms