Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms