Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms