Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd9Q9D9M4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms