Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D9D9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9D9D9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D9D9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D9D9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D9D9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms