Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc70Q9D9B0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms