Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms