Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gtf3c6Q9D8P7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c6Q9D8P7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms