Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms