Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms