Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl40Q9D783 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl40Q9D783 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms