Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4aQ9D6F9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms