Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms