Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam227bQ9D518 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam227bQ9D518 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms