Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D4W2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D4W2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D4W2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D4W2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D4W2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms