Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930556J24RikQ9D4U7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms