Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms