Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ribc2Q9D4Q1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ribc2Q9D4Q1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ribc2Q9D4Q1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ribc2Q9D4Q1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms