Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lonrf3Q9D4H7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms