Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms