Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgms2Q9D4B1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms