Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D454 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D454 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D454 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D454 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D454 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D454 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D454 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D454 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D454 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D454 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D454 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D454 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D454 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D454 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D454 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D454 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D454 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D454 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D454 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D454 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D454 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D454 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D454 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D454 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D454 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D454 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D454 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D454 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D454 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D454 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D454 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D454 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D454 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D454 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D454 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D454 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D454 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D454 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D454 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D454 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D454 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D454 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D454 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D454 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D454 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D454 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D454 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D454 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D454 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D454 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D454 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D454 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D454 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D454 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D454 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D454 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D454 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D454 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D454 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D454 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D454 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D454 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D454 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D454 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D454 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D454 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D454 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D454 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms