Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms