Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933436I01RikQ9D3T1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms