Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx29Q9D3S3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx29Q9D3S3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx29Q9D3S3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx29Q9D3S3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx29Q9D3S3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx29Q9D3S3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx29Q9D3S3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx29Q9D3S3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx29Q9D3S3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx29Q9D3S3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx29Q9D3S3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx29Q9D3S3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx29Q9D3S3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx29Q9D3S3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx29Q9D3S3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx29Q9D3S3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx29Q9D3S3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx29Q9D3S3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx29Q9D3S3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx29Q9D3S3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx29Q9D3S3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms