Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3P1

Tchhl1, Trichohyalin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tchhl1Q9D3P1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tchhl1Q9D3P1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms