Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.05■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
5430402E10RikQ9D3N5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.05■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.05■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.04■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
5430402E10RikQ9D3N5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms