Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3H9

5530401A14Rik, RIKEN cDNA 5530401A14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5530401A14RikQ9D3H9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5530401A14RikQ9D3H9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5530401A14RikQ9D3H9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms