Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt20Q9D312 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt20Q9D312 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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