Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx20Q9D2Y5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Snx20Q9D2Y5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Snx20Q9D2Y5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx20Q9D2Y5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms