Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms