Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krtap5-3Q9D226 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krtap5-3Q9D226 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms