Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chordc1Q9D1P4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms