Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hddc3Q9D114 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc3Q9D114 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc3Q9D114 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc3Q9D114 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc3Q9D114 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc3Q9D114 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc3Q9D114 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc3Q9D114 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc3Q9D114 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc3Q9D114 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc3Q9D114 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc3Q9D114 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc3Q9D114 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc3Q9D114 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc3Q9D114 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc3Q9D114 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc3Q9D114 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc3Q9D114 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc3Q9D114 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.3 ms