Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms