Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms