Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf146Q9CZW6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf146Q9CZW6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf146Q9CZW6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf146Q9CZW6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf146Q9CZW6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf146Q9CZW6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf146Q9CZW6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms