Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cmss1Q9CZT6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cmss1Q9CZT6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cmss1Q9CZT6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cmss1Q9CZT6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cmss1Q9CZT6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cmss1Q9CZT6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cmss1Q9CZT6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cmss1Q9CZT6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cmss1Q9CZT6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cmss1Q9CZT6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cmss1Q9CZT6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cmss1Q9CZT6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cmss1Q9CZT6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cmss1Q9CZT6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cmss1Q9CZT6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cmss1Q9CZT6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cmss1Q9CZT6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cmss1Q9CZT6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cmss1Q9CZT6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms